Το Koyasan επισκέπτεται καλύτερα τους μήνες Απρίλιο και Οκτώβριο, όταν ο καιρός είναι ήπιος και το φύλλωμα είναι σε πλήρη άνθιση. Τους χειμερινούς μήνες, το Koyasan είναι αρκετά κρύο με χιόνι, και κατά τους καλοκαιρινούς μήνες, είναι αρκετά ζεστό και υγρό.