Koyasan ofrece una variedad de opciones de alojamiento, que van desde templos y santuarios tradicionales hasta hoteles modernos. Algunas de las opciones más populares son el Shukubo, que son alojamientos en templos tradicionales que ofrecen una experiencia inmersiva en la cultura y la historia de la zona, y el Koyasan Onsen Ryokan, que ofrece una experiencia más moderna y lujosa.