Koyasan offre une variété d'options d'hébergement, allant des temples et sanctuaires traditionnels aux hôtels modernes. Certains des choix les plus populaires sont les Shukubo, qui sont des logements de temple traditionnels qui offrent une expérience immersive dans la culture et l'histoire de la région, et le Koyasan Onsen Ryokan, qui offre une expérience plus moderne et luxueuse.