दक्षिण पूर्व एशिया में मुख्य द्वीप सुमात्रा, जावा, बोर्नियो, सुलावेसी, मालुकु द्वीप और फिलीपीन द्वीपसमूह हैं। इस क्षेत्र के अन्य प्रमुख द्वीपों में तिमोर, बाली, लोम्बोक और सिमेउलू शामिल हैं।