Vatnajökull National Park में एक उप-आर्कटिक जलवायु है, जहाँ तापमान गर्मियों में -4 से 12 डिग्री सेल्सियस और सर्दियों में -10 से -2 डिग्री सेल्सियस तक रहता है। 1,000 मिलीमीटर से अधिक औसत वार्षिक वर्षा के साथ वर्षा काफी अधिक है।
