Koyasan offre una varietà di opzioni di alloggio, che vanno dai templi e santuari tradizionali agli hotel moderni. Alcune delle scelte più popolari sono gli Shukubo, che sono tradizionali alloggi del tempio che offrono un'esperienza immersiva nella cultura e nella storia della zona, e il Koyasan Onsen Ryokan, che offre un'esperienza più moderna e lussuosa.